Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx6-3Q3UHX8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx6-3Q3UHX8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx6-3Q3UHX8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx6-3Q3UHX8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx6-3Q3UHX8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx6-3Q3UHX8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx6-3Q3UHX8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx6-3Q3UHX8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx6-3Q3UHX8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx6-3Q3UHX8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx6-3Q3UHX8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx6-3Q3UHX8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx6-3Q3UHX8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx6-3Q3UHX8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx6-3Q3UHX8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx6-3Q3UHX8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx6-3Q3UHX8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx6-3Q3UHX8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx6-3Q3UHX8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx6-3Q3UHX8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx6-3Q3UHX8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx6-3Q3UHX8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx6-3Q3UHX8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkx6-3Q3UHX8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx6-3Q3UHX8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx6-3Q3UHX8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nkx6-3Q3UHX8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx6-3Q3UHX8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx6-3Q3UHX8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx6-3Q3UHX8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx6-3Q3UHX8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx6-3Q3UHX8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx6-3Q3UHX8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx6-3Q3UHX8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms