Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pitpnm3Q3UHE1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pitpnm3Q3UHE1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pitpnm3Q3UHE1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pitpnm3Q3UHE1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pitpnm3Q3UHE1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pitpnm3Q3UHE1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pitpnm3Q3UHE1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pitpnm3Q3UHE1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pitpnm3Q3UHE1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pitpnm3Q3UHE1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pitpnm3Q3UHE1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pitpnm3Q3UHE1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pitpnm3Q3UHE1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pitpnm3Q3UHE1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pitpnm3Q3UHE1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pitpnm3Q3UHE1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms