Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc177Q3UHB8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc177Q3UHB8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc177Q3UHB8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc177Q3UHB8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc177Q3UHB8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms