Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip13Q3UA06 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trip13Q3UA06 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trip13Q3UA06 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trip13Q3UA06 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trip13Q3UA06 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms