Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl21Q3U410 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl21Q3U410 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhl21Q3U410 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl21Q3U410 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl21Q3U410 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl21Q3U410 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl21Q3U410 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl21Q3U410 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl21Q3U410 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl21Q3U410 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl21Q3U410 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl21Q3U410 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl21Q3U410 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl21Q3U410 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl21Q3U410 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl21Q3U410 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl21Q3U410 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms