Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gse1Q3U3C9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gse1Q3U3C9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gse1Q3U3C9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gse1Q3U3C9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gse1Q3U3C9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gse1Q3U3C9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms