Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ87

March9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March9Q3TZ87 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
March9Q3TZ87 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
March9Q3TZ87 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
March9Q3TZ87 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
March9Q3TZ87 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
March9Q3TZ87 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
March9Q3TZ87 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
March9Q3TZ87 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
March9Q3TZ87 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
March9Q3TZ87 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
March9Q3TZ87 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
March9Q3TZ87 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
March9Q3TZ87 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
March9Q3TZ87 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
March9Q3TZ87 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
March9Q3TZ87 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
March9Q3TZ87 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
March9Q3TZ87 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
March9Q3TZ87 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
March9Q3TZ87 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
March9Q3TZ87 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
March9Q3TZ87 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
March9Q3TZ87 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
March9Q3TZ87 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
March9Q3TZ87 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
March9Q3TZ87 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
March9Q3TZ87 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
March9Q3TZ87 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
March9Q3TZ87 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
March9Q3TZ87 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
March9Q3TZ87 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
March9Q3TZ87 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
March9Q3TZ87 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms