Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rufy4Q3TYX8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rufy4Q3TYX8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rufy4Q3TYX8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rufy4Q3TYX8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rufy4Q3TYX8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rufy4Q3TYX8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rufy4Q3TYX8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rufy4Q3TYX8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rufy4Q3TYX8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rufy4Q3TYX8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rufy4Q3TYX8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rufy4Q3TYX8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rufy4Q3TYX8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rufy4Q3TYX8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rufy4Q3TYX8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rufy4Q3TYX8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rufy4Q3TYX8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rufy4Q3TYX8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rufy4Q3TYX8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rufy4Q3TYX8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rufy4Q3TYX8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rufy4Q3TYX8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rufy4Q3TYX8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rufy4Q3TYX8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rufy4Q3TYX8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rufy4Q3TYX8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rufy4Q3TYX8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rufy4Q3TYX8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rufy4Q3TYX8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rufy4Q3TYX8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rufy4Q3TYX8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rufy4Q3TYX8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rufy4Q3TYX8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rufy4Q3TYX8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rufy4Q3TYX8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms