Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Smarca4Q3TKT4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC42.82■■■■■ 4.45
Smarca4Q3TKT4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Smarca4Q3TKT4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Smarca4Q3TKT4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Smarca4Q3TKT4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Smarca4Q3TKT4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Smarca4Q3TKT4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Smarca4Q3TKT4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
Smarca4Q3TKT4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Smarca4Q3TKT4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Smarca4Q3TKT4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Smarca4Q3TKT4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Smarca4Q3TKT4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Smarca4Q3TKT4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Smarca4Q3TKT4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Smarca4Q3TKT4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.43
Smarca4Q3TKT4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
Smarca4Q3TKT4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
Smarca4Q3TKT4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Smarca4Q3TKT4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Smarca4Q3TKT4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
Smarca4Q3TKT4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Smarca4Q3TKT4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Smarca4Q3TKT4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Smarca4Q3TKT4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Smarca4Q3TKT4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Smarca4Q3TKT4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Smarca4Q3TKT4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Smarca4Q3TKT4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Smarca4Q3TKT4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
Smarca4Q3TKT4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Smarca4Q3TKT4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
Smarca4Q3TKT4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Smarca4Q3TKT4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Smarca4Q3TKT4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Smarca4Q3TKT4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Smarca4Q3TKT4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Smarca4Q3TKT4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
Smarca4Q3TKT4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.4
Smarca4Q3TKT4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Smarca4Q3TKT4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
Smarca4Q3TKT4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Smarca4Q3TKT4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Smarca4Q3TKT4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Smarca4Q3TKT4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Smarca4Q3TKT4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
Smarca4Q3TKT4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Smarca4Q3TKT4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Smarca4Q3TKT4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Smarca4Q3TKT4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Smarca4Q3TKT4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
Smarca4Q3TKT4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Smarca4Q3TKT4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Smarca4Q3TKT4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Smarca4Q3TKT4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
Smarca4Q3TKT4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Smarca4Q3TKT4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Smarca4Q3TKT4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Smarca4Q3TKT4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Smarca4Q3TKT4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Smarca4Q3TKT4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
Smarca4Q3TKT4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Smarca4Q3TKT4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Smarca4Q3TKT4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Smarca4Q3TKT4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Smarca4Q3TKT4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Smarca4Q3TKT4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Smarca4Q3TKT4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Smarca4Q3TKT4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Smarca4Q3TKT4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Smarca4Q3TKT4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Smarca4Q3TKT4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Smarca4Q3TKT4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Smarca4Q3TKT4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Smarca4Q3TKT4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Smarca4Q3TKT4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Smarca4Q3TKT4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Smarca4Q3TKT4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Smarca4Q3TKT4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Smarca4Q3TKT4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
Smarca4Q3TKT4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Smarca4Q3TKT4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms