Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIV5

Zc3h15, Zinc finger CCCH domain-containing protein 15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h15Q3TIV5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Zc3h15Q3TIV5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zc3h15Q3TIV5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zc3h15Q3TIV5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zc3h15Q3TIV5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Zc3h15Q3TIV5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zc3h15Q3TIV5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zc3h15Q3TIV5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Zc3h15Q3TIV5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zc3h15Q3TIV5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zc3h15Q3TIV5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zc3h15Q3TIV5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zc3h15Q3TIV5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zc3h15Q3TIV5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zc3h15Q3TIV5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zc3h15Q3TIV5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zc3h15Q3TIV5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zc3h15Q3TIV5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zc3h15Q3TIV5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zc3h15Q3TIV5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Zc3h15Q3TIV5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zc3h15Q3TIV5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zc3h15Q3TIV5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zc3h15Q3TIV5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zc3h15Q3TIV5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zc3h15Q3TIV5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Zc3h15Q3TIV5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Zc3h15Q3TIV5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Zc3h15Q3TIV5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms