Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnfaip8l3Q3TBL6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnfaip8l3Q3TBL6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnfaip8l3Q3TBL6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnfaip8l3Q3TBL6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnfaip8l3Q3TBL6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnfaip8l3Q3TBL6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnfaip8l3Q3TBL6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnfaip8l3Q3TBL6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnfaip8l3Q3TBL6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnfaip8l3Q3TBL6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms