Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
V1rd19Q3KNP5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V1rd19Q3KNP5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
V1rd19Q3KNP5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V1rd19Q3KNP5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms