Protein–RNA interactions for Protein: Q14DH7

Acss3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss3Q14DH7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acss3Q14DH7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acss3Q14DH7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acss3Q14DH7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Acss3Q14DH7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acss3Q14DH7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms