Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Traf3ip1Q149C2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Traf3ip1Q149C2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Traf3ip1Q149C2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Traf3ip1Q149C2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Traf3ip1Q149C2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Traf3ip1Q149C2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Traf3ip1Q149C2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Traf3ip1Q149C2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Traf3ip1Q149C2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Traf3ip1Q149C2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Traf3ip1Q149C2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Traf3ip1Q149C2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Traf3ip1Q149C2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Traf3ip1Q149C2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Traf3ip1Q149C2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Traf3ip1Q149C2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Traf3ip1Q149C2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Traf3ip1Q149C2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Traf3ip1Q149C2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Traf3ip1Q149C2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Traf3ip1Q149C2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Traf3ip1Q149C2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Traf3ip1Q149C2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Traf3ip1Q149C2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Traf3ip1Q149C2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Traf3ip1Q149C2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Traf3ip1Q149C2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Traf3ip1Q149C2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Traf3ip1Q149C2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Traf3ip1Q149C2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Traf3ip1Q149C2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Traf3ip1Q149C2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Traf3ip1Q149C2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Traf3ip1Q149C2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Traf3ip1Q149C2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Traf3ip1Q149C2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Traf3ip1Q149C2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Traf3ip1Q149C2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Traf3ip1Q149C2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Traf3ip1Q149C2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Traf3ip1Q149C2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Traf3ip1Q149C2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Traf3ip1Q149C2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Traf3ip1Q149C2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Traf3ip1Q149C2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Traf3ip1Q149C2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Traf3ip1Q149C2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Traf3ip1Q149C2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Traf3ip1Q149C2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Traf3ip1Q149C2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Traf3ip1Q149C2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Traf3ip1Q149C2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Traf3ip1Q149C2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Traf3ip1Q149C2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Traf3ip1Q149C2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Traf3ip1Q149C2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Traf3ip1Q149C2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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