Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Perm1Q149B8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Perm1Q149B8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Perm1Q149B8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Perm1Q149B8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Perm1Q149B8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Perm1Q149B8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Perm1Q149B8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Perm1Q149B8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Perm1Q149B8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Perm1Q149B8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Perm1Q149B8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Perm1Q149B8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Perm1Q149B8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms