Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG62

Uncharacterized protein C8orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q0VG62 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q0VG62 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q0VG62 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q0VG62 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q0VG62 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q0VG62 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q0VG62 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q0VG62 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q0VG62 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q0VG62 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q0VG62 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q0VG62 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q0VG62 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q0VG62 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q0VG62 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q0VG62 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q0VG62 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q0VG62 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q0VG62 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q0VG62 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q0VG62 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Q0VG62 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q0VG62 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q0VG62 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q0VG62 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q0VG62 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q0VG62 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q0VG62 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q0VG62 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q0VG62 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q0VG62 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q0VG62 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q0VG62 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q0VG62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q0VG62 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q0VG62 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q0VG62 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q0VG62 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q0VG62 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q0VG62 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q0VG62 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q0VG62 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q0VG62 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q0VG62 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q0VG62 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q0VG62 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q0VG62 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q0VG62 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q0VG62 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q0VG62 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q0VG62 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q0VG62 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q0VG62 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q0VG62 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q0VG62 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q0VG62 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q0VG62 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q0VG62 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q0VG62 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q0VG62 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q0VG62 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q0VG62 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q0VG62 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q0VG62 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q0VG62 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q0VG62 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q0VG62 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q0VG62 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q0VG62 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q0VG62 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q0VG62 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q0VG62 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q0VG62 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q0VG62 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q0VG62 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q0VG62 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q0VG62 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q0VG62 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q0VG62 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q0VG62 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q0VG62 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q0VG62 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q0VG62 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q0VG62 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q0VG62 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q0VG62 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q0VG62 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q0VG62 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q0VG62 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q0VG62 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q0VG62 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q0VG62 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q0VG62 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q0VG62 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q0VG62 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q0VG62 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q0VG62 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q0VG62 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q0VG62 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q0VG62 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms