Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpne7Q0VE82 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpne7Q0VE82 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpne7Q0VE82 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpne7Q0VE82 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpne7Q0VE82 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpne7Q0VE82 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpne7Q0VE82 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpne7Q0VE82 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpne7Q0VE82 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpne7Q0VE82 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpne7Q0VE82 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpne7Q0VE82 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpne7Q0VE82 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpne7Q0VE82 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpne7Q0VE82 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpne7Q0VE82 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpne7Q0VE82 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpne7Q0VE82 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne7Q0VE82 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpne7Q0VE82 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms