Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cib3Q0P523 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cib3Q0P523 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cib3Q0P523 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cib3Q0P523 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cib3Q0P523 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms