Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calb2Q08331 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calb2Q08331 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calb2Q08331 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Calb2Q08331 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.5 ms