Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CbfbQ08024 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CbfbQ08024 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CbfbQ08024 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CbfbQ08024 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CbfbQ08024 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CbfbQ08024 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CbfbQ08024 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CbfbQ08024 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CbfbQ08024 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CbfbQ08024 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CbfbQ08024 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CbfbQ08024 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CbfbQ08024 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CbfbQ08024 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CbfbQ08024 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CbfbQ08024 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CbfbQ08024 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CbfbQ08024 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CbfbQ08024 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CbfbQ08024 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CbfbQ08024 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CbfbQ08024 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CbfbQ08024 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CbfbQ08024 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CbfbQ08024 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CbfbQ08024 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CbfbQ08024 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CbfbQ08024 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CbfbQ08024 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CbfbQ08024 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CbfbQ08024 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CbfbQ08024 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CbfbQ08024 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CbfbQ08024 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CbfbQ08024 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CbfbQ08024 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CbfbQ08024 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CbfbQ08024 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CbfbQ08024 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CbfbQ08024 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CbfbQ08024 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms