Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrepQ07475 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NrepQ07475 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NrepQ07475 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NrepQ07475 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NrepQ07475 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NrepQ07475 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NrepQ07475 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NrepQ07475 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NrepQ07475 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NrepQ07475 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms