Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdr16c6Q05A13 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdr16c6Q05A13 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdr16c6Q05A13 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdr16c6Q05A13 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdr16c6Q05A13 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdr16c6Q05A13 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdr16c6Q05A13 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdr16c6Q05A13 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdr16c6Q05A13 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdr16c6Q05A13 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdr16c6Q05A13 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdr16c6Q05A13 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdr16c6Q05A13 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdr16c6Q05A13 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdr16c6Q05A13 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdr16c6Q05A13 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdr16c6Q05A13 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdr16c6Q05A13 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdr16c6Q05A13 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdr16c6Q05A13 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sdr16c6Q05A13 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdr16c6Q05A13 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 615.4 ms