Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col9a1Q05722 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col9a1Q05722 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col9a1Q05722 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col9a1Q05722 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col9a1Q05722 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col9a1Q05722 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col9a1Q05722 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col9a1Q05722 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Col9a1Q05722 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col9a1Q05722 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col9a1Q05722 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col9a1Q05722 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col9a1Q05722 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col9a1Q05722 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Col9a1Q05722 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col9a1Q05722 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col9a1Q05722 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col9a1Q05722 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col9a1Q05722 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a1Q05722 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col9a1Q05722 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Col9a1Q05722 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms