Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rcn1Q05186 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rcn1Q05186 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rcn1Q05186 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcn1Q05186 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms