Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sox9Q04887 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sox9Q04887 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox9Q04887 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox9Q04887 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox9Q04887 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox9Q04887 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox9Q04887 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox9Q04887 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox9Q04887 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox9Q04887 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox9Q04887 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox9Q04887 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox9Q04887 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox9Q04887 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox9Q04887 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox9Q04887 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox9Q04887 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox9Q04887 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox9Q04887 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox9Q04887 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox9Q04887 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox9Q04887 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sox9Q04887 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox9Q04887 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox9Q04887 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sox9Q04887 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox9Q04887 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox9Q04887 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox9Q04887 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sox9Q04887 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox9Q04887 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sox9Q04887 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox9Q04887 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sox9Q04887 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sox9Q04887 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sox9Q04887 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sox9Q04887 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms