Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nf1Q04690 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nf1Q04690 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nf1Q04690 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nf1Q04690 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nf1Q04690 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms