Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp39Q02525 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp39Q02525 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp39Q02525 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp39Q02525 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms