Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd1Q01822 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd1Q01822 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd1Q01822 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd1Q01822 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd1Q01822 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms