Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gjb2Q00977 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gjb2Q00977 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjb2Q00977 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjb2Q00977 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjb2Q00977 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gjb2Q00977 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjb2Q00977 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjb2Q00977 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjb2Q00977 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjb2Q00977 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjb2Q00977 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjb2Q00977 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjb2Q00977 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjb2Q00977 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjb2Q00977 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjb2Q00977 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjb2Q00977 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjb2Q00977 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjb2Q00977 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gjb2Q00977 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gjb2Q00977 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gjb2Q00977 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gjb2Q00977 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gjb2Q00977 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gjb2Q00977 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gjb2Q00977 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gjb2Q00977 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gjb2Q00977 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms