Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pax8Q00288 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pax8Q00288 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax8Q00288 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax8Q00288 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax8Q00288 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax8Q00288 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax8Q00288 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax8Q00288 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax8Q00288 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pax8Q00288 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax8Q00288 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax8Q00288 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pax8Q00288 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pax8Q00288 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pax8Q00288 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pax8Q00288 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pax8Q00288 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pax8Q00288 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pax8Q00288 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pax8Q00288 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms