Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bmp1P98063 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bmp1P98063 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bmp1P98063 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bmp1P98063 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Bmp1P98063 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bmp1P98063 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bmp1P98063 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bmp1P98063 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bmp1P98063 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bmp1P98063 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bmp1P98063 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Bmp1P98063 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Bmp1P98063 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bmp1P98063 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bmp1P98063 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bmp1P98063 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bmp1P98063 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bmp1P98063 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bmp1P98063 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bmp1P98063 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bmp1P98063 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bmp1P98063 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bmp1P98063 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bmp1P98063 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bmp1P98063 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Bmp1P98063 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bmp1P98063 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bmp1P98063 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bmp1P98063 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bmp1P98063 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bmp1P98063 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bmp1P98063 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bmp1P98063 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Bmp1P98063 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bmp1P98063 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bmp1P98063 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms