Protein–RNA interactions for Protein: P97864

Casp7, Caspase-7, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp7P97864 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp7P97864 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casp7P97864 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp7P97864 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp7P97864 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casp7P97864 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casp7P97864 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casp7P97864 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casp7P97864 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp7P97864 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casp7P97864 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casp7P97864 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casp7P97864 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casp7P97864 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casp7P97864 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp7P97864 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp7P97864 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp7P97864 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casp7P97864 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Casp7P97864 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casp7P97864 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casp7P97864 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casp7P97864 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casp7P97864 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casp7P97864 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Casp7P97864 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casp7P97864 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Casp7P97864 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casp7P97864 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Casp7P97864 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Casp7P97864 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Casp7P97864 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Casp7P97864 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Casp7P97864 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Casp7P97864 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp7P97864 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp7P97864 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp7P97864 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp7P97864 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp7P97864 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Casp7P97864 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Casp7P97864 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casp7P97864 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casp7P97864 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Casp7P97864 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp7P97864 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp7P97864 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp7P97864 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp7P97864 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp7P97864 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Casp7P97864 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp7P97864 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casp7P97864 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp7P97864 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp7P97864 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp7P97864 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp7P97864 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp7P97864 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp7P97864 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp7P97864 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp7P97864 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp7P97864 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp7P97864 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp7P97864 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Casp7P97864 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp7P97864 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp7P97864 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casp7P97864 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casp7P97864 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Casp7P97864 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms