Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbx1P82976 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbx1P82976 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbx1P82976 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gbx1P82976 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gbx1P82976 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms