Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gabpb2P81069 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gabpb2P81069 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gabpb2P81069 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gabpb2P81069 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gabpb2P81069 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gabpb2P81069 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gabpb2P81069 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gabpb2P81069 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gabpb2P81069 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gabpb2P81069 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gabpb2P81069 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gabpb2P81069 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gabpb2P81069 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gabpb2P81069 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gabpb2P81069 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms