Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-Q6P79568 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q6P79568 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q6P79568 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Q6P79568 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms