Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gjb6P70689 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb6P70689 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb6P70689 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb6P70689 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb6P70689 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gjb6P70689 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms