Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ErfP70459 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ErfP70459 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ErfP70459 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ErfP70459 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ErfP70459 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ErfP70459 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ErfP70459 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ErfP70459 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ErfP70459 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ErfP70459 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErfP70459 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ErfP70459 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ErfP70459 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ErfP70459 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ErfP70459 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ErfP70459 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErfP70459 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErfP70459 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErfP70459 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErfP70459 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErfP70459 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErfP70459 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErfP70459 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErfP70459 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErfP70459 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErfP70459 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ErfP70459 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ErfP70459 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ErfP70459 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ErfP70459 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ErfP70459 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ErfP70459 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ErfP70459 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ErfP70459 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ErfP70459 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ErfP70459 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ErfP70459 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ErfP70459 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ErfP70459 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ErfP70459 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ErfP70459 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ErfP70459 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ErfP70459 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ErfP70459 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ErfP70459 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ErfP70459 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ErfP70459 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ErfP70459 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ErfP70459 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ErfP70459 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ErfP70459 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ErfP70459 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ErfP70459 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ErfP70459 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ErfP70459 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ErfP70459 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ErfP70459 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ErfP70459 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ErfP70459 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ErfP70459 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ErfP70459 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ErfP70459 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ErfP70459 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ErfP70459 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ErfP70459 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ErfP70459 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ErfP70459 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ErfP70459 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ErfP70459 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ErfP70459 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ErfP70459 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ErfP70459 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ErfP70459 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ErfP70459 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ErfP70459 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ErfP70459 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ErfP70459 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ErfP70459 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ErfP70459 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ErfP70459 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ErfP70459 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ErfP70459 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ErfP70459 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ErfP70459 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ErfP70459 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ErfP70459 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ErfP70459 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ErfP70459 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ErfP70459 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ErfP70459 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ErfP70459 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ErfP70459 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ErfP70459 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ErfP70459 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ErfP70459 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ErfP70459 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ErfP70459 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ErfP70459 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ErfP70459 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms