Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad50P70388 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rad50P70388 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rad50P70388 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad50P70388 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rad50P70388 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad50P70388 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rad50P70388 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad50P70388 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad50P70388 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad50P70388 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad50P70388 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad50P70388 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad50P70388 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad50P70388 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad50P70388 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad50P70388 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad50P70388 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad50P70388 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad50P70388 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad50P70388 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad50P70388 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad50P70388 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad50P70388 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad50P70388 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad50P70388 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad50P70388 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad50P70388 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad50P70388 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad50P70388 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad50P70388 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad50P70388 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad50P70388 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad50P70388 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad50P70388 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad50P70388 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad50P70388 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad50P70388 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad50P70388 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms