Protein–RNA interactions for Protein: P70160

Calca, Calcitonin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcaP70160 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CalcaP70160 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CalcaP70160 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CalcaP70160 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CalcaP70160 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CalcaP70160 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CalcaP70160 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CalcaP70160 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CalcaP70160 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CalcaP70160 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CalcaP70160 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CalcaP70160 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CalcaP70160 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CalcaP70160 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CalcaP70160 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CalcaP70160 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CalcaP70160 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CalcaP70160 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CalcaP70160 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CalcaP70160 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CalcaP70160 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CalcaP70160 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CalcaP70160 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CalcaP70160 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CalcaP70160 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CalcaP70160 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CalcaP70160 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CalcaP70160 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CalcaP70160 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CalcaP70160 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CalcaP70160 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CalcaP70160 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CalcaP70160 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CalcaP70160 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CalcaP70160 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CalcaP70160 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CalcaP70160 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CalcaP70160 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CalcaP70160 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CalcaP70160 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CalcaP70160 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CalcaP70160 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CalcaP70160 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CalcaP70160 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CalcaP70160 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CalcaP70160 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CalcaP70160 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CalcaP70160 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CalcaP70160 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CalcaP70160 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CalcaP70160 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CalcaP70160 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CalcaP70160 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CalcaP70160 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CalcaP70160 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CalcaP70160 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CalcaP70160 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CalcaP70160 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CalcaP70160 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CalcaP70160 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CalcaP70160 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CalcaP70160 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CalcaP70160 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CalcaP70160 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CalcaP70160 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CalcaP70160 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CalcaP70160 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CalcaP70160 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CalcaP70160 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CalcaP70160 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CalcaP70160 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CalcaP70160 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CalcaP70160 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CalcaP70160 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CalcaP70160 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CalcaP70160 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CalcaP70160 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CalcaP70160 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CalcaP70160 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CalcaP70160 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CalcaP70160 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CalcaP70160 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CalcaP70160 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CalcaP70160 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CalcaP70160 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CalcaP70160 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CalcaP70160 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CalcaP70160 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CalcaP70160 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms