Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actg1P63260 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Actg1P63260 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actg1P63260 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actg1P63260 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actg1P63260 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actg1P63260 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Actg1P63260 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Actg1P63260 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actg1P63260 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Actg1P63260 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Actg1P63260 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Actg1P63260 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actg1P63260 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actg1P63260 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actg1P63260 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actg1P63260 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actg1P63260 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Actg1P63260 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actg1P63260 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Actg1P63260 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Actg1P63260 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actg1P63260 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actg1P63260 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actg1P63260 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 993.5 ms