Protein–RNA interactions for Protein: P62814

Atp6v1b2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1b2P62814 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v1b2P62814 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6v1b2P62814 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v1b2P62814 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6v1b2P62814 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1b2P62814 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1b2P62814 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1b2P62814 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1b2P62814 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1b2P62814 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1b2P62814 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1b2P62814 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1b2P62814 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6v1b2P62814 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6v1b2P62814 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6v1b2P62814 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6v1b2P62814 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6v1b2P62814 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms