Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrch1P62046 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lrch1P62046 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lrch1P62046 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrch1P62046 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrch1P62046 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrch1P62046 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrch1P62046 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrch1P62046 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrch1P62046 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrch1P62046 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrch1P62046 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrch1P62046 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrch1P62046 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrch1P62046 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrch1P62046 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrch1P62046 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrch1P62046 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrch1P62046 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lrch1P62046 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrch1P62046 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrch1P62046 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrch1P62046 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrch1P62046 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrch1P62046 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrch1P62046 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrch1P62046 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrch1P62046 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrch1P62046 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrch1P62046 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrch1P62046 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrch1P62046 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrch1P62046 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrch1P62046 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrch1P62046 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrch1P62046 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrch1P62046 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lrch1P62046 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms