Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d1P61080 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d1P61080 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms