Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppfia3P60469 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppfia3P60469 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppfia3P60469 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfia3P60469 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfia3P60469 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfia3P60469 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfia3P60469 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppfia3P60469 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfia3P60469 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfia3P60469 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ppfia3P60469 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ppfia3P60469 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppfia3P60469 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppfia3P60469 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppfia3P60469 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppfia3P60469 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppfia3P60469 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppfia3P60469 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppfia3P60469 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppfia3P60469 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfia3P60469 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfia3P60469 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppfia3P60469 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppfia3P60469 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppfia3P60469 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppfia3P60469 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms