Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcmtd1P59913 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcmtd1P59913 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcmtd1P59913 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcmtd1P59913 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pcmtd1P59913 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pcmtd1P59913 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pcmtd1P59913 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms