Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NcstnP57716 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NcstnP57716 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NcstnP57716 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NcstnP57716 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NcstnP57716 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NcstnP57716 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NcstnP57716 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NcstnP57716 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NcstnP57716 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NcstnP57716 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NcstnP57716 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NcstnP57716 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NcstnP57716 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NcstnP57716 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NcstnP57716 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NcstnP57716 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NcstnP57716 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NcstnP57716 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NcstnP57716 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NcstnP57716 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms