Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pex2P55098 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pex2P55098 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pex2P55098 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pex2P55098 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pex2P55098 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pex2P55098 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pex2P55098 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pex2P55098 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pex2P55098 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pex2P55098 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pex2P55098 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pex2P55098 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pex2P55098 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pex2P55098 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pex2P55098 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pex2P55098 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms