Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NcanP55066 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NcanP55066 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NcanP55066 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NcanP55066 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NcanP55066 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NcanP55066 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NcanP55066 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NcanP55066 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NcanP55066 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NcanP55066 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NcanP55066 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NcanP55066 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NcanP55066 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NcanP55066 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NcanP55066 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NcanP55066 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NcanP55066 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NcanP55066 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NcanP55066 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NcanP55066 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NcanP55066 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NcanP55066 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NcanP55066 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NcanP55066 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NcanP55066 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NcanP55066 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NcanP55066 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NcanP55066 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NcanP55066 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NcanP55066 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NcanP55066 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NcanP55066 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NcanP55066 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NcanP55066 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NcanP55066 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NcanP55066 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NcanP55066 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NcanP55066 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NcanP55066 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NcanP55066 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NcanP55066 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NcanP55066 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NcanP55066 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NcanP55066 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NcanP55066 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NcanP55066 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NcanP55066 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NcanP55066 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NcanP55066 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NcanP55066 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NcanP55066 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NcanP55066 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NcanP55066 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NcanP55066 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NcanP55066 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NcanP55066 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NcanP55066 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NcanP55066 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NcanP55066 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NcanP55066 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NcanP55066 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NcanP55066 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NcanP55066 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NcanP55066 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NcanP55066 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NcanP55066 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NcanP55066 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NcanP55066 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NcanP55066 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NcanP55066 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NcanP55066 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NcanP55066 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NcanP55066 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NcanP55066 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NcanP55066 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NcanP55066 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NcanP55066 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NcanP55066 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NcanP55066 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NcanP55066 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NcanP55066 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NcanP55066 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NcanP55066 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NcanP55066 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NcanP55066 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NcanP55066 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NcanP55066 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NcanP55066 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NcanP55066 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NcanP55066 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NcanP55066 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NcanP55066 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NcanP55066 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NcanP55066 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NcanP55066 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NcanP55066 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NcanP55066 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NcanP55066 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NcanP55066 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
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