Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atxn1P54254 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn1P54254 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn1P54254 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn1P54254 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn1P54254 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn1P54254 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms