Protein–RNA interactions for Protein: P53668

Limk1, LIM domain kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk1P53668 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk1P53668 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Limk1P53668 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Limk1P53668 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Limk1P53668 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Limk1P53668 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Limk1P53668 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Limk1P53668 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Limk1P53668 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limk1P53668 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Limk1P53668 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms